More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0604 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 504 aa  1025    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  67.14 
 
 		 500 aa  666    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  72.82 
 
 		 504 aa  741    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  67.88 
 
 		 496 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  69.25 
 
 		 503 aa  725    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  57.53 
 
 		 485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  56.11 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  57.36 
 
 		 460 aa  524  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  49.69 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  48.47 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  49.08 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  48.27 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  48.38 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  47.68 
 
 		 514 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  47.77 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  48.07 
 
 		 492 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.37 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.86 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  47.74 
 
 		 508 aa  448  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  46.94 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  47.05 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  46.3 
 
 		 511 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  46.96 
 
 		 509 aa  435  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.9 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  42.28 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  41.96 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  40.7 
 
 		 490 aa  361  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 		 503 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  41.67 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 522 aa  352  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  40.12 
 
 		 491 aa  349  7e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 509 aa  346  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 532 aa  339  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  39.37 
 
 		 517 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  39.13 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 531 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  39.05 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  39.05 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  39.11 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  39.16 
 
 		 508 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  38.17 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 513 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  38.89 
 
 		 515 aa  327  3e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.81 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 515 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.08 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  37.35 
 
 		 507 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  39.09 
 
 		 515 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  39.72 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  44.59 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  44 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  38.41 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39 
 
 		 503 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  38.57 
 
 		 505 aa  323  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  38.57 
 
 		 505 aa  322  8e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  46.24 
 
 		 386 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  38.67 
 
 		 526 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  44.59 
 
 		 386 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  44.86 
 
 		 386 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  39.38 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  38.37 
 
 		 505 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  39.45 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.54 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 511 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 514 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  39.45 
 
 		 536 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  37.63 
 
 		 479 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  39.31 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 541 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  38.49 
 
 		 519 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  39.15 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  39.06 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  38.46 
 
 		 516 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 518 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  39.03 
 
 		 514 aa  315  9e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  39.4 
 
 		 513 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  38.94 
 
 		 555 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  46.15 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  38.63 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  39.27 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  37.25 
 
 		 513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  38.68 
 
 		 516 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  37.45 
 
 		 510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  38.72 
 
 		 518 aa  313  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 513 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 529 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  38.48 
 
 		 521 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>