More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1171 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  100 
 
 		 394 aa  806    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  57.34 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  57.26 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  53.32 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  52.86 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  55.59 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  51.23 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  51.51 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  49.86 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  48.22 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  48.77 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  49.04 
 
 		 492 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  48.92 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  52.45 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 500 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.86 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  50.55 
 
 		 515 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  48.8 
 
 		 503 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.74 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  47.62 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  47.2 
 
 		 503 aa  338  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  46.74 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  47.01 
 
 		 518 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  45.36 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  46.72 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  46.98 
 
 		 515 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  47.77 
 
 		 506 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  47.91 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  48.8 
 
 		 460 aa  334  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  46.6 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 509 aa  333  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  46.98 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  46.19 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  47.24 
 
 		 506 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  47.24 
 
 		 506 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  46.83 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  45.48 
 
 		 516 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  48.28 
 
 		 505 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  47.73 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  48 
 
 		 500 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  47.77 
 
 		 506 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  46.56 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  46.19 
 
 		 519 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  46.28 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  46.74 
 
 		 513 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  46.3 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  46.75 
 
 		 517 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  46.79 
 
 		 532 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 		 511 aa  325  6e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  47.73 
 
 		 500 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  46.54 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  46.81 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 514 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 		 515 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  48.28 
 
 		 508 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  43.68 
 
 		 499 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  45.29 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  45.53 
 
 		 522 aa  319  5e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 		 510 aa  319  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  46.15 
 
 		 510 aa  319  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  45.12 
 
 		 509 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  49.31 
 
 		 496 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  45.5 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.38 
 
 		 504 aa  317  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  45.24 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  44.83 
 
 		 507 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  45.21 
 
 		 509 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  45.21 
 
 		 509 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  45.84 
 
 		 516 aa  316  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  45.29 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  45.74 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  46.3 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  46.01 
 
 		 527 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  48.38 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  47.81 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  47.81 
 
 		 556 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  44.3 
 
 		 518 aa  312  7.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  47.86 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  44.79 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  45.04 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  47.07 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  46.54 
 
 		 515 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  45.24 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  48.01 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  45.84 
 
 		 511 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  46.81 
 
 		 514 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  45.09 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  42.78 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  44.95 
 
 		 504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>