More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2402 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  72.34 
 
 		 503 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  100 
 
 		 500 aa  996    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  68.54 
 
 		 504 aa  656    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  67.07 
 
 		 504 aa  681    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  70.3 
 
 		 496 aa  662    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  58.26 
 
 		 485 aa  561  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  57.59 
 
 		 483 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  59.07 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  48.88 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  49.49 
 
 		 492 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  48.47 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  48.07 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  48.27 
 
 		 492 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  51.86 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  47.17 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  46.06 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  50.41 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  50.51 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  46.56 
 
 		 514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  46.76 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  49.69 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  48.17 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.23 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.6 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  44.01 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  42.07 
 
 		 507 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 510 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 525 aa  361  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 491 aa  359  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.6 
 
 		 490 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  42.21 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.86 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 511 aa  349  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  43.4 
 
 		 514 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 509 aa  346  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.37 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.24 
 
 		 517 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  42.12 
 
 		 509 aa  342  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 515 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  42.05 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  47.04 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 508 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  41.4 
 
 		 513 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  37.88 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  41.4 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  42.63 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  46.22 
 
 		 377 aa  329  7e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  41.63 
 
 		 514 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 507 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 503 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  41.09 
 
 		 530 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  46.78 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.89 
 
 		 531 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.19 
 
 		 536 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  37.7 
 
 		 515 aa  325  9e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.19 
 
 		 536 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  47.24 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  41 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  41 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  41.2 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  41.57 
 
 		 516 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  39.51 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  41.48 
 
 		 515 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  39.62 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  39.01 
 
 		 505 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 515 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  40.39 
 
 		 546 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.01 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  40.27 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  41.24 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  41.2 
 
 		 515 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.01 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  41.54 
 
 		 517 aa  317  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  39.55 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  38.2 
 
 		 515 aa  316  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 515 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 513 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  39.05 
 
 		 532 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  39.13 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  40.56 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  39.28 
 
 		 512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  38.82 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  41.47 
 
 		 540 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 516 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>