More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2360 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 479 aa  973    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  65.13 
 
 		 522 aa  633  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  64.69 
 
 		 490 aa  622  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  62.79 
 
 		 491 aa  594  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  66.25 
 
 		 411 aa  558  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  52.94 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  52.33 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  46.2 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  46.01 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  45.36 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  44.94 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  42.47 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.24 
 
 		 505 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  38.45 
 
 		 485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  39.71 
 
 		 505 aa  339  8e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.71 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.71 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  40.41 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  40.45 
 
 		 513 aa  331  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  38.9 
 
 		 517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  39.5 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  36.89 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  47.85 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  37.42 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  37.74 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  36.95 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.21 
 
 		 492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  37.21 
 
 		 492 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  37.63 
 
 		 504 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  36.8 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.83 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  36.63 
 
 		 515 aa  315  8e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  38.43 
 
 		 525 aa  315  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  47.85 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  47.56 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  38.34 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  37.4 
 
 		 515 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  36.96 
 
 		 507 aa  312  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  45.85 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  46.99 
 
 		 387 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  36.17 
 
 		 519 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.82 
 
 		 504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  37.76 
 
 		 509 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  46.02 
 
 		 406 aa  306  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  36.98 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  38.02 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  47.53 
 
 		 345 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  47.46 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  38.24 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  38.67 
 
 		 511 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  36.53 
 
 		 520 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  37.5 
 
 		 541 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  36.4 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  37.16 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.7 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  37.83 
 
 		 529 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  37.63 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  36.99 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  37.27 
 
 		 516 aa  300  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  37.34 
 
 		 525 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  38.49 
 
 		 520 aa  299  9e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  38.46 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  36.44 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  36.53 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  36.81 
 
 		 539 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  37.74 
 
 		 519 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  35.48 
 
 		 520 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  37.47 
 
 		 516 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  35.99 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  36.81 
 
 		 539 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  37.4 
 
 		 519 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  36.53 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.85 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  36.8 
 
 		 536 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  36.8 
 
 		 536 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  36.16 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  36.16 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  37.81 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  36.16 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  37.07 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  36.72 
 
 		 521 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  37.22 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  35.77 
 
 		 511 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  36.72 
 
 		 532 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  37.27 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  38.57 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  36.1 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  36.85 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  36.29 
 
 		 523 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  36.51 
 
 		 524 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  36.08 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  36.1 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  36.08 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  36.02 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>