More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2770 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 438 aa  889    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  87.8 
 
 		 446 aa  741    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  71.03 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  78.36 
 
 		 345 aa  560  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  76.15 
 
 		 345 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  50.8 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  48.08 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  47.67 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.23 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  40.71 
 
 		 514 aa  329  7e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  50.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  42.23 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.74 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.9 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  41.97 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  47.85 
 
 		 479 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  41.71 
 
 		 514 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  47.22 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  44.56 
 
 		 520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.47 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.1 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  44.03 
 
 		 520 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  44.03 
 
 		 520 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  42.7 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  42.68 
 
 		 555 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.74 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.07 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.61 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  42.71 
 
 		 521 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.93 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.38 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.73 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  41.88 
 
 		 505 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  41.73 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  51.07 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  42.01 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  42.78 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  39.47 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  42.24 
 
 		 514 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  45.48 
 
 		 510 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.38 
 
 		 509 aa  286  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  41.99 
 
 		 519 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.2 
 
 		 492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.13 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.29 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.48 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  42.01 
 
 		 525 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  41.46 
 
 		 526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  41.18 
 
 		 510 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.93 
 
 		 500 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  42.3 
 
 		 529 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 527 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  40.05 
 
 		 386 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  42.04 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  42.04 
 
 		 529 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  42.78 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  40.63 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  40.82 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  40.62 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.21 
 
 		 509 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.29 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  41.46 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  41.31 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.76 
 
 		 504 aa  276  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  40.34 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 507 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  40.91 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 517 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 527 aa  276  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  42.44 
 
 		 519 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  41.01 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  41.97 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.11 
 
 		 512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  41.55 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  40.74 
 
 		 541 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  41.04 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  41.26 
 
 		 515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  43.34 
 
 		 523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  39.89 
 
 		 511 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  40.99 
 
 		 524 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.14 
 
 		 485 aa  273  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.34 
 
 		 381 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  40.26 
 
 		 556 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  39.79 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>