More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0906 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  87.8 
 
 		 438 aa  741    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 446 aa  905    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  71.8 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  78.84 
 
 		 345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  77.71 
 
 		 345 aa  547  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  49.59 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  49.73 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  47.25 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  46.3 
 
 		 522 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  41.82 
 
 		 514 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  42.75 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  43.26 
 
 		 514 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.93 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 514 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  44.81 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  47.56 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  45.78 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.21 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  43.92 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.61 
 
 		 347 aa  294  3e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.6 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  43.22 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  43.24 
 
 		 520 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  45.51 
 
 		 378 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.57 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  43.82 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.3 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  39.02 
 
 		 492 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.62 
 
 		 512 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.41 
 
 		 517 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  42.97 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  42.97 
 
 		 520 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.93 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  41.11 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  44.18 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 509 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  37.67 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  42.45 
 
 		 555 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  41.42 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.48 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  41.41 
 
 		 525 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  41.03 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  41.97 
 
 		 522 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  50 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 529 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  40.75 
 
 		 505 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.38 
 
 		 532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  41.99 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  40.85 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.31 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  41.73 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  41.75 
 
 		 526 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  40.31 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  39.66 
 
 		 386 aa  273  7e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  41.47 
 
 		 520 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  41.5 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  41.47 
 
 		 519 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  41.39 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.12 
 
 		 485 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  38.67 
 
 		 499 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  40.74 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  41.76 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  38.15 
 
 		 386 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  40.38 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  40.58 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  39.95 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  38.64 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 		 528 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  39.95 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.53 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 527 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  42.3 
 
 		 523 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  41.22 
 
 		 527 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.22 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 513 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 520 aa  266  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  40.87 
 
 		 522 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 512 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  39.95 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  42.23 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  37.78 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  38.92 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 514 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  39.57 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 521 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  39.9 
 
 		 541 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>