More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1522 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 387 aa  792    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  73.85 
 
 		 386 aa  567  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  73.39 
 
 		 377 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  72.24 
 
 		 380 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  71.13 
 
 		 382 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  71.81 
 
 		 383 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  72.12 
 
 		 381 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  68 
 
 		 383 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  68.62 
 
 		 390 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  68.28 
 
 		 385 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  65.77 
 
 		 381 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  56.6 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  56.68 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  56.25 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  53.17 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  56.01 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  55.16 
 
 		 382 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  54.64 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  52.17 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  53.91 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  53.1 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  52.86 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  52.72 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  52.59 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  52.88 
 
 		 377 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  51.03 
 
 		 384 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  51.22 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  50.14 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  49.59 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  48.13 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  47.88 
 
 		 378 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  47.4 
 
 		 378 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  46.2 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  46.2 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  46.65 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  46.54 
 
 		 492 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  45.98 
 
 		 492 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  45.04 
 
 		 514 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  45.71 
 
 		 492 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  44.77 
 
 		 514 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  43.31 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  43.83 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  44.62 
 
 		 514 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.78 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  44.26 
 
 		 492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  44.47 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  43.12 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  45.98 
 
 		 381 aa  305  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  42.66 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.18 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  42.61 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  42.36 
 
 		 485 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  42.05 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  42.09 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  42.82 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.41 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  43.77 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  43.9 
 
 		 375 aa  293  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  44.53 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  43.19 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  42.9 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.76 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  41.11 
 
 		 516 aa  289  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.48 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  41.73 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  42.59 
 
 		 511 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.91 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  43.36 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  43.8 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  44.44 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  43.34 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  41.78 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  42.32 
 
 		 508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  43.57 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.99 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  41.35 
 
 		 504 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  44.2 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.2 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  52.24 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  41.37 
 
 		 515 aa  279  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  41.62 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  38.32 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  43.35 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  40.91 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.95 
 
 		 347 aa  276  6e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  41.71 
 
 		 509 aa  275  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  43.12 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  43.22 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  41.55 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  44.16 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  43.68 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  39.67 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0409  pyruvate carboxyltransferase  53.06 
 
 		 301 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000285195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  41.04 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  42.74 
 
 		 372 aa  269  8e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>