More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0876 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 387 aa  782    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  71.8 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  71.03 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  73.84 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  71.01 
 
 		 345 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  47.65 
 
 		 502 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  47.54 
 
 		 491 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  45.88 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  46.05 
 
 		 522 aa  332  8e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  49.52 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.19 
 
 		 505 aa  316  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  41.64 
 
 		 514 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  43.4 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.59 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  43.67 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  46.99 
 
 		 479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  43.13 
 
 		 514 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  43.27 
 
 		 505 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  43.01 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  43.32 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  43.01 
 
 		 505 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  43.27 
 
 		 520 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.9 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 520 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 520 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.87 
 
 		 503 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  43.01 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  45.66 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 521 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  42.3 
 
 		 406 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  43.16 
 
 		 520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  43.01 
 
 		 519 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  46.15 
 
 		 510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  39.74 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.07 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  42.71 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  41.09 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 509 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  39.35 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  40.63 
 
 		 532 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.26 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  41.24 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.84 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.23 
 
 		 492 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 505 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  38.95 
 
 		 492 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  39.79 
 
 		 555 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.1 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 512 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  42.36 
 
 		 526 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 568 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  38.61 
 
 		 485 aa  272  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  42.98 
 
 		 516 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  39.23 
 
 		 514 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  42.33 
 
 		 528 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 523 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  42.08 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.15 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  41.34 
 
 		 519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.42 
 
 		 507 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  39.21 
 
 		 508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  41.18 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 527 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  41.47 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.44 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  40.05 
 
 		 515 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  41.73 
 
 		 522 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  38.12 
 
 		 492 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  42.9 
 
 		 529 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  39.47 
 
 		 510 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  43.16 
 
 		 529 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  39.15 
 
 		 386 aa  268  8e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  39.95 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 524 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 521 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  39.63 
 
 		 556 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  46.79 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  41.64 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.44 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.94 
 
 		 347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.49 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.02 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 517 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 511 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  38.04 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.26 
 
 		 516 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  38.52 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  40.87 
 
 		 514 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  39.37 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 513 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 516 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  39.51 
 
 		 503 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  42.36 
 
 		 529 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  39.5 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>