More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1815 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 490 aa  989    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  71.98 
 
 		 491 aa  711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  63.67 
 
 		 522 aa  634    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  74.69 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  64.69 
 
 		 479 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  56.1 
 
 		 502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  56.01 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  50.41 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  49.59 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  49.18 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.33 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  43.21 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.03 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  42.62 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  41.31 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.74 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.37 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.7 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  37.17 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  36.97 
 
 		 492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  42.92 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.6 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.85 
 
 		 517 aa  360  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.26 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.1 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  48.08 
 
 		 438 aa  353  5e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  35.29 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  41.65 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  39.56 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  47.25 
 
 		 446 aa  345  8e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 505 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 513 aa  342  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  48.21 
 
 		 389 aa  342  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  45.88 
 
 		 387 aa  342  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.04 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 509 aa  339  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.28 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  39.12 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  39.81 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  40.61 
 
 		 529 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 514 aa  335  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 509 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  37.17 
 
 		 503 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  39.61 
 
 		 536 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 515 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  39.39 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  39.52 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  46.17 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  38.63 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.16 
 
 		 511 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  48.92 
 
 		 378 aa  329  7e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  39.26 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  47.26 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  48.36 
 
 		 372 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  37.58 
 
 		 527 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  39.72 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  41.95 
 
 		 568 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  38.4 
 
 		 518 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  40.33 
 
 		 516 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  37.18 
 
 		 519 aa  326  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 519 aa  326  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 520 aa  326  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  48.77 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  38.83 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  39.6 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  38.17 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  40.43 
 
 		 528 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  37.95 
 
 		 521 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  39.33 
 
 		 514 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  38.79 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 517 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  46.61 
 
 		 377 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  38.68 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  38.31 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  38.62 
 
 		 541 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  38.55 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  36.95 
 
 		 523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  37.15 
 
 		 523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 516 aa  319  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.53 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  37.98 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>