More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0942 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 502 aa  1025    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  63.78 
 
 		 500 aa  672    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  66.97 
 
 		 442 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  58.74 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  56.1 
 
 		 490 aa  569  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 		 522 aa  558  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 514 aa  525  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  52.02 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  52.94 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  51.01 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  57.64 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  44.99 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.82 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  46.06 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  45.86 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  45.25 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  45.25 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  43.65 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  44.65 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  44.14 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  43.11 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  42.28 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.72 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.03 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  44.92 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  43.69 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  41.9 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  42.44 
 
 		 518 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  42.19 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  42.02 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  43.14 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  42.69 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  42.69 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.77 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.79 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  40.62 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  41.17 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  41.68 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.32 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  42.04 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  47.63 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  44.31 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  41.21 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  40.84 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.78 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  49.59 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  40.99 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  47.65 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 		 513 aa  362  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 520 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  38.88 
 
 		 508 aa  359  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  41.23 
 
 		 536 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 520 aa  358  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  40.78 
 
 		 529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  40.56 
 
 		 517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 513 aa  356  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  40.35 
 
 		 516 aa  356  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  40.59 
 
 		 529 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.94 
 
 		 508 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 515 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  41.04 
 
 		 541 aa  355  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  37.68 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 529 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 523 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 511 aa  352  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  38.98 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  39.38 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  40.7 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  41.94 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  42.31 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  40.31 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  40.59 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  39.1 
 
 		 520 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 522 aa  349  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  39.89 
 
 		 624 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 521 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  49.57 
 
 		 345 aa  348  9e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  41.35 
 
 		 530 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  37.94 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>