More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1671 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  100 
 
 		 411 aa  832    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  74.69 
 
 		 490 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  66.25 
 
 		 479 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  67.25 
 
 		 491 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  62.59 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  57.53 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  57.64 
 
 		 502 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  57.21 
 
 		 500 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  51.12 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49.63 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  49.38 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  47.42 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  42.75 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  44.06 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  43.69 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.24 
 
 		 505 aa  319  5e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  43.38 
 
 		 517 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  39.36 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.12 
 
 		 492 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.36 
 
 		 492 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.38 
 
 		 525 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  39.27 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  39.11 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  42.01 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  41.23 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.24 
 
 		 504 aa  299  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  42.82 
 
 		 536 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  42.82 
 
 		 536 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 505 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.35 
 
 		 511 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 512 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  42.72 
 
 		 536 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 509 aa  296  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  39.95 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  41.77 
 
 		 515 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 530 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.2 
 
 		 504 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  38.48 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  41.63 
 
 		 531 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.53 
 
 		 507 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.64 
 
 		 500 aa  292  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.63 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.63 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  50.35 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 515 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  39.86 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  51.07 
 
 		 438 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.85 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  39.86 
 
 		 539 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  39.61 
 
 		 522 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41 
 
 		 496 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  40.62 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  41.26 
 
 		 540 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  42.16 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 546 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  38.52 
 
 		 532 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  38.48 
 
 		 515 aa  282  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  40.49 
 
 		 513 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  49.82 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  41.03 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.34 
 
 		 516 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  39.28 
 
 		 518 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  40.53 
 
 		 513 aa  279  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  40.15 
 
 		 508 aa  279  8e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  40.1 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  39.86 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 525 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  38.63 
 
 		 523 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  47.97 
 
 		 345 aa  277  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  38.63 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  38.39 
 
 		 523 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 556 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  40.29 
 
 		 516 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  38.39 
 
 		 555 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 521 aa  275  8e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.15 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  43.16 
 
 		 568 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  39.9 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 520 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  38.41 
 
 		 532 aa  272  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.67 
 
 		 520 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  39.07 
 
 		 513 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 499 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  39.71 
 
 		 511 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  41.03 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>