More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0260 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  71.34 
 
 		 492 aa  730    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 492 aa  994    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  84.76 
 
 		 492 aa  871    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  96.75 
 
 		 492 aa  968    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  95.53 
 
 		 492 aa  958    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  55.12 
 
 		 485 aa  553  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  54.23 
 
 		 460 aa  510  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  52.47 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  51.63 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  49.9 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  49.59 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  49.08 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.88 
 
 		 496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  44.87 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  44.98 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  43.99 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  44.4 
 
 		 511 aa  428  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.28 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  46.06 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  43.61 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  43.41 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.53 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.77 
 
 		 394 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  43.82 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  51.87 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  37.17 
 
 		 490 aa  362  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  41.78 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  52.85 
 
 		 389 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.91 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  49.86 
 
 		 382 aa  350  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  40.84 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.98 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 511 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  40.54 
 
 		 442 aa  347  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.3 
 
 		 509 aa  347  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  53.13 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  52.99 
 
 		 378 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.99 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  39.8 
 
 		 505 aa  343  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.6 
 
 		 505 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 521 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  49.05 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  42.21 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  47.66 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 522 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 523 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 523 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 523 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  40.87 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  42.23 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  41.24 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 520 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 519 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  46.07 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  38.65 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 518 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 503 aa  329  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  46.61 
 
 		 386 aa  329  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  38.97 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  46.61 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  46.88 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  46.88 
 
 		 381 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 556 aa  326  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  48.41 
 
 		 380 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  39.09 
 
 		 524 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  39.4 
 
 		 515 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  42.43 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  40.72 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  38.66 
 
 		 515 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>