More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0217 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 483 aa  981    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  72.14 
 
 		 485 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  64.13 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  57.97 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  56.11 
 
 		 504 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  57.8 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  57.44 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  54.02 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  53.5 
 
 		 492 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  58.13 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  52.47 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  52.47 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  52.26 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  49.49 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  48.56 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.94 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  48.97 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  47.83 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  47.92 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  45.92 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.65 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  46.79 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.35 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  46.28 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  42.62 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.68 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  43.99 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.97 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 507 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.07 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.88 
 
 		 509 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  42.28 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 511 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  41.3 
 
 		 505 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.62 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.89 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.69 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  40.82 
 
 		 442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  41.58 
 
 		 513 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  40.65 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.89 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.89 
 
 		 512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.21 
 
 		 505 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  40.45 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  49.71 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.49 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  50.73 
 
 		 389 aa  339  7e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  39.02 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  38.21 
 
 		 524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  39.1 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  38.21 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 		 536 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  39.43 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 		 536 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.72 
 
 		 511 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 530 aa  336  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 532 aa  336  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 516 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 515 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  37.6 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.64 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  37.74 
 
 		 479 aa  334  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  50.88 
 
 		 378 aa  333  5e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  39.43 
 
 		 524 aa  333  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  37.17 
 
 		 522 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 515 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  38.41 
 
 		 532 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  38.49 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 531 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  39.23 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  45.3 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.43 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  39.35 
 
 		 523 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 520 aa  329  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  39.43 
 
 		 527 aa  329  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 541 aa  329  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  38.41 
 
 		 521 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  38.13 
 
 		 521 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  38.34 
 
 		 514 aa  326  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  38.82 
 
 		 541 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  38.78 
 
 		 516 aa  326  7e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  37.83 
 
 		 515 aa  325  8.000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.86 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39.15 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  41.06 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 511 aa  323  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  39.07 
 
 		 524 aa  322  7e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  38.41 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>