More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1158 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  84.94 
 
 		 386 aa  695    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  87.01 
 
 		 386 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  85.19 
 
 		 386 aa  697    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 386 aa  798    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  72.7 
 
 		 387 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  51.52 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 		 514 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  48.75 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.05 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  47.67 
 
 		 492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  47.4 
 
 		 492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.72 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  46.63 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  47.2 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  45.97 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  46.03 
 
 		 492 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  46.88 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  45.16 
 
 		 502 aa  332  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  46.07 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.8 
 
 		 505 aa  328  8e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  44.02 
 
 		 500 aa  326  6e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  44.38 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.24 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.72 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  45.3 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.16 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.63 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  45.27 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  44.35 
 
 		 388 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.92 
 
 		 500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  45.43 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.61 
 
 		 387 aa  301  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  43.71 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  43.65 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  44.25 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.63 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  43.5 
 
 		 503 aa  299  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  44.03 
 
 		 381 aa  299  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  41.76 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  43.6 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  41.76 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  41.55 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  42.93 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  43.15 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  43.39 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  43.09 
 
 		 522 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  41.26 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  40.62 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  42.54 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 491 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  40.74 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.18 
 
 		 504 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  40.82 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.18 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.77 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 		 517 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  40.52 
 
 		 479 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  40.34 
 
 		 438 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  45.51 
 
 		 507 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.47 
 
 		 525 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  39.27 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  39.01 
 
 		 524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 507 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  41.59 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  40.06 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  44.99 
 
 		 515 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  40.58 
 
 		 527 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  39.72 
 
 		 516 aa  272  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  41.8 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  40 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  41.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  43.22 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  38.87 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.1 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  41.29 
 
 		 520 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 532 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 519 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  40.74 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  40.86 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 521 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  41.6 
 
 		 520 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.84 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  40.78 
 
 		 398 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  40.21 
 
 		 520 aa  265  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  39.22 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  39.35 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  38.96 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  40.42 
 
 		 377 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>