More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0232 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 388 aa  803    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  62.2 
 
 		 376 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  58.87 
 
 		 376 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  54.91 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  54.99 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  50.14 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  50.53 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  61.16 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  45.09 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  44.71 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  44.56 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  44.56 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  44.35 
 
 		 386 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  41.64 
 
 		 514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  43.05 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.16 
 
 		 394 aa  305  6e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  42.48 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  43.32 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.86 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  41.44 
 
 		 492 aa  298  9e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  42.27 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  42.23 
 
 		 492 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  43.55 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  42.82 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  42.2 
 
 		 503 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.01 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  42.82 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  41.92 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.25 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.91 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  41.42 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  42.27 
 
 		 483 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  42.98 
 
 		 490 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  41.46 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  41.29 
 
 		 504 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.38 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.14 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.98 
 
 		 496 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  38.52 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  41.18 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 489 aa  269  5e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  40.86 
 
 		 475 aa  269  8e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 372 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  41.76 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  40.11 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  41.89 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  39.78 
 
 		 503 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  38.21 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  40.78 
 
 		 522 aa  266  7e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  38.52 
 
 		 515 aa  265  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  40.83 
 
 		 377 aa  266  7e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  39.62 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  42.78 
 
 		 479 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  39.34 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  38.56 
 
 		 518 aa  258  9e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  38.68 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  38.52 
 
 		 377 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  38.32 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  40.3 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  37.53 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  38.32 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  37.97 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  38.06 
 
 		 525 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  35.96 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  38.04 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  37.76 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  37.47 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  37.29 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  37.53 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  38.28 
 
 		 515 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  36.86 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  36.86 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  38.31 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  38.07 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  39.07 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  37.39 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  37.13 
 
 		 507 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  36.55 
 
 		 513 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  37.17 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  39.31 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  36.29 
 
 		 512 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  38.26 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  37.06 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  38.7 
 
 		 505 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  35.64 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  38.26 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  37.24 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  35.77 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  38.25 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  36.86 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  36.03 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  37.6 
 
 		 510 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.7 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  37.5 
 
 		 521 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  36.12 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>