More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0603 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 522 aa  1068    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  65.13 
 
 		 479 aa  633  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  63.67 
 
 		 490 aa  627  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  62.86 
 
 		 491 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 		 502 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  62.59 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  51.36 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.11 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  46.25 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  46.34 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  46.04 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  46.28 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  43.39 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.77 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  43.06 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  42.66 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  42.09 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  42.69 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.38 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.98 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  42.44 
 
 		 513 aa  364  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  42.28 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  41.89 
 
 		 541 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  40.4 
 
 		 492 aa  360  5e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 541 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  39.61 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 519 aa  356  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  41.03 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  41.84 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.76 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.76 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  41.83 
 
 		 546 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 515 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40 
 
 		 504 aa  352  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  39.76 
 
 		 492 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  41.31 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  41.81 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  39.19 
 
 		 492 aa  350  5e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  41.19 
 
 		 512 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 511 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  40.77 
 
 		 530 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  40.74 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 521 aa  347  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  49.06 
 
 		 377 aa  347  4e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  41.24 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  41.54 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.94 
 
 		 516 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 518 aa  345  8.999999999999999e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  42.53 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 527 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 509 aa  345  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  41.21 
 
 		 529 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  40.61 
 
 		 539 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  41.02 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  47.67 
 
 		 438 aa  343  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  42.3 
 
 		 540 aa  343  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  39.24 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  40.42 
 
 		 539 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  38.87 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 519 aa  340  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  38.98 
 
 		 532 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  39.13 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  38.65 
 
 		 522 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  40.62 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.08 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  41.96 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  38.28 
 
 		 520 aa  337  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  46.3 
 
 		 446 aa  336  7e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 519 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 		 546 aa  336  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  43.27 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  48.37 
 
 		 406 aa  335  2e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  42.02 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  39.25 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  38.57 
 
 		 524 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  39.25 
 
 		 523 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 519 aa  333  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  39.25 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  46.05 
 
 		 387 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  38.6 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  40.39 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  41.44 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  38.82 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>