More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2111 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  71.98 
 
 		 490 aa  711    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 491 aa  1000    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  62.86 
 
 		 522 aa  623  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  62.79 
 
 		 479 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  58.74 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  57.89 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  67.25 
 
 		 411 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  57.5 
 
 		 442 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  49.59 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  48.79 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 514 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 		 514 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.69 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  43.83 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  41.53 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  41.21 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  40.93 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  40.73 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  42.97 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.71 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  42.68 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  50.8 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  38.99 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  42.89 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  49.73 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.53 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  47.54 
 
 		 387 aa  362  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  42.21 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.16 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.8 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.17 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.71 
 
 		 505 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  40.71 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 509 aa  348  9e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  40.97 
 
 		 541 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.51 
 
 		 496 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  40.31 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.7 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.7 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  40.49 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  38.6 
 
 		 503 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  40.31 
 
 		 541 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 519 aa  340  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  39.85 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  40.28 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.84 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.7 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  49.25 
 
 		 345 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 514 aa  336  7e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 530 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 518 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  40.08 
 
 		 508 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  39.12 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 529 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 512 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 507 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  40.6 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.59 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 508 aa  332  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  40.81 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  39.52 
 
 		 523 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  41.89 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  47.79 
 
 		 377 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  39.12 
 
 		 523 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  47.51 
 
 		 389 aa  330  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 523 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  49.38 
 
 		 345 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  40.88 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  39.03 
 
 		 546 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 529 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  39.52 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 515 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  46.17 
 
 		 406 aa  326  7e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  39.13 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  38.76 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  40.66 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  39.6 
 
 		 516 aa  325  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.41 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  40.73 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  39 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>