More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1442 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  100 
 
 		 496 aa  1004    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  70.93 
 
 		 504 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  70.35 
 
 		 500 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  67.88 
 
 		 504 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  74.09 
 
 		 503 aa  746    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  58.97 
 
 		 485 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  58.13 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  60.18 
 
 		 460 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  49.08 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  48.27 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  48.88 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  47.86 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  47.86 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.08 
 
 		 514 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  47.37 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  47.35 
 
 		 516 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  47.31 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.25 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  46.69 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  47.23 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  45.49 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  41.77 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  42.43 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  44.38 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.51 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  43.09 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  40.04 
 
 		 490 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.7 
 
 		 509 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 		 510 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  42.38 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 505 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  41.78 
 
 		 508 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  40.56 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  49.31 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  42.28 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.63 
 
 		 509 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  41.35 
 
 		 512 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 516 aa  343  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  40.68 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40.59 
 
 		 514 aa  339  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.36 
 
 		 505 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  41.9 
 
 		 511 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 		 505 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  46.28 
 
 		 377 aa  332  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  41.7 
 
 		 515 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.53 
 
 		 406 aa  332  1e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  38.66 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 516 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  38.6 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 530 aa  330  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  41.48 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  41.17 
 
 		 539 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  46.51 
 
 		 389 aa  329  6e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 		 514 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  40.97 
 
 		 539 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  40.64 
 
 		 516 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 		 514 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 		 514 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  40.39 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 514 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  40.92 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 531 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 		 515 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 524 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  39.53 
 
 		 520 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 514 aa  326  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  42.15 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  38.84 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  39.61 
 
 		 536 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 513 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  40.83 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  41.03 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  40.93 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  38.8 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 515 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  38.85 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.08 
 
 		 519 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>