More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2428 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  75.29 
 
 		 515 aa  757    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  67 
 
 		 516 aa  643    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 509 aa  990    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  68.18 
 
 		 508 aa  664    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  67.32 
 
 		 511 aa  656    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  51.45 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  51.31 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.96 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  49.69 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  43.38 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  46.79 
 
 		 483 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  48.25 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.3 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  43.41 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  43.2 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  42.8 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.23 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  42.42 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  41.2 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  41.2 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  41 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.65 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 502 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 525 aa  320  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  40.24 
 
 		 517 aa  316  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  37 
 
 		 503 aa  313  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  38.28 
 
 		 507 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  40.53 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 509 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  36.35 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  39.28 
 
 		 521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  38.65 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 513 aa  302  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.29 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  38.11 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  37.83 
 
 		 508 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  38.8 
 
 		 527 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  38.04 
 
 		 519 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  37.3 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 532 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  37.52 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  38.4 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.25 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  38.31 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  37.15 
 
 		 523 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  35.5 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 524 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 506 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 506 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  37.4 
 
 		 532 aa  293  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 506 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 506 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  37.22 
 
 		 514 aa  292  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  37.55 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  36.71 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  37.78 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  36.82 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  37.45 
 
 		 506 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  36.75 
 
 		 521 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  37.05 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  37.85 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.36 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  37.3 
 
 		 500 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  37.94 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  37.2 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  37.35 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  36.73 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  40.91 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  37.3 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  36.22 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  36.98 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  37.45 
 
 		 515 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  36.42 
 
 		 515 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  36.4 
 
 		 530 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  36.73 
 
 		 524 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  36.82 
 
 		 511 aa  286  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  37.35 
 
 		 515 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  35.32 
 
 		 510 aa  286  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  38.03 
 
 		 511 aa  286  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  37.38 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  37.1 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  36.12 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  36.8 
 
 		 520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  36.73 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  36.8 
 
 		 520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  37.15 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  38.05 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  36.93 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  41.87 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  38.6 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  37.13 
 
 		 520 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  36.4 
 
 		 515 aa  283  5.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 524 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>