More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1069 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  73.61 
 
 
504 aa  733    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  74.09 
 
 
496 aa  706    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  72.39 
 
 
500 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  69.25 
 
 
504 aa  725    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  100 
 
 
503 aa  1003    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  58.76 
 
 
485 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  57.97 
 
 
483 aa  548  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  60.26 
 
 
460 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  49.9 
 
 
492 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  49.9 
 
 
492 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  48.88 
 
 
492 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  48.58 
 
 
514 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  48.88 
 
 
492 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  48.18 
 
 
514 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  49.29 
 
 
492 aa  478  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  48.38 
 
 
514 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  47.98 
 
 
514 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.26 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  48.4 
 
 
516 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  48.35 
 
 
508 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.82 
 
 
505 aa  421  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  48.25 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  47.11 
 
 
511 aa  415  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  46.03 
 
 
500 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  46.53 
 
 
515 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.11 
 
 
502 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  44.47 
 
 
503 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.97 
 
 
491 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  44.09 
 
 
509 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  44.21 
 
 
525 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.31 
 
 
490 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41.9 
 
 
510 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.22 
 
 
507 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  42.38 
 
 
507 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 
442 aa  353  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 
511 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 
514 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 
499 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 
522 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 
505 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.8 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 
517 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 
509 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 
532 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  42.32 
 
 
511 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 
508 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.19 
 
 
509 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.12 
 
 
505 aa  333  5e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 
505 aa  329  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.71 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 
516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  39.25 
 
 
516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  42.37 
 
 
508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  41.48 
 
 
516 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 
505 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  41.58 
 
 
513 aa  326  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  39.5 
 
 
479 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.82 
 
 
406 aa  324  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 
532 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  41.92 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  41.92 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  41.92 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  37.57 
 
 
515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  43.69 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  39.53 
 
 
515 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.03 
 
 
389 aa  320  3e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 
512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  41.73 
 
 
516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 
515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  41.41 
 
 
514 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  41.85 
 
 
515 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 
515 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.08 
 
 
515 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 
511 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  40.93 
 
 
516 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  39.56 
 
 
514 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 
519 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 
515 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 
527 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  40.93 
 
 
511 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  38.64 
 
 
518 aa  316  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 
536 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  40.35 
 
 
536 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  40.35 
 
 
536 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 
503 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  41.24 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  39 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.7 
 
 
531 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  41.6 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 
518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  40.66 
 
 
530 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 
513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 
514 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  39.7 
 
 
555 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  39.57 
 
 
539 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  38.68 
 
 
515 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  39.28 
 
 
515 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  40.5 
 
 
517 aa  312  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>