More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0476 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  73.33 
 
 		 515 aa  706    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  68.85 
 
 		 516 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 511 aa  992    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  67.32 
 
 		 509 aa  656    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  87.99 
 
 		 508 aa  875    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  51.55 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  50.1 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.3 
 
 		 504 aa  435  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  49.78 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  44.4 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  47.92 
 
 		 483 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  44.81 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  44.6 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  43.38 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.05 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  42.77 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  47.11 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.4 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.69 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  43.23 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  40.96 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.28 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  37.68 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 500 aa  349  7e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  40.49 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 522 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  38.17 
 
 		 507 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.29 
 
 		 389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  38.32 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  38.72 
 
 		 510 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  36.09 
 
 		 503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  37.74 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  37.52 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  37.72 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  36.9 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  37.52 
 
 		 507 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  36.2 
 
 		 513 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  38.66 
 
 		 514 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  36.83 
 
 		 514 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  37.33 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  34.71 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  37.88 
 
 		 511 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 		 406 aa  296  7e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.8 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.28 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  36.58 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  36.51 
 
 		 515 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  37.28 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  36.38 
 
 		 523 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  37.25 
 
 		 520 aa  292  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 513 aa  292  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  37.52 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  38.55 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  38.32 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  35.82 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  35.89 
 
 		 524 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  35.55 
 
 		 524 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  36.24 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  34.71 
 
 		 520 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  36.93 
 
 		 519 aa  290  6e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  36.33 
 
 		 515 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  37.33 
 
 		 527 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  35.55 
 
 		 524 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  39.84 
 
 		 382 aa  289  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  37.67 
 
 		 515 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  37.57 
 
 		 505 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  36.78 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.59 
 
 		 387 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  37.03 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  36.69 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  42.82 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  36.49 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  36.49 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  36.49 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  37.38 
 
 		 517 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  35.87 
 
 		 525 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  36.98 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  36.38 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  36.98 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.12 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  36.77 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  36.49 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  36.49 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  40.33 
 
 		 381 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  35.49 
 
 		 541 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  36.85 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  37.83 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  35.55 
 
 		 536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  35.55 
 
 		 536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  36.78 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  37.22 
 
 		 532 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  38.8 
 
 		 383 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  40.8 
 
 		 382 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  38.04 
 
 		 442 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>