More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0675 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  70.73 
 
 		 492 aa  728    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 492 aa  990    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  71.34 
 
 		 492 aa  730    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  72.15 
 
 		 492 aa  737    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  71.95 
 
 		 492 aa  731    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  55.94 
 
 		 485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  54.02 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  54.45 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  49.69 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  49.69 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  49.29 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.16 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  46.68 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  47.48 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  45.47 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  45.67 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  45.27 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.86 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  43.15 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.88 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  43.57 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  42.97 
 
 		 508 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  43.38 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  42.77 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  43.18 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.22 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  44.42 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  48.64 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  38.99 
 
 		 491 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  42.46 
 
 		 516 aa  362  8e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  41.78 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 509 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  42.94 
 
 		 510 aa  359  7e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  39.72 
 
 		 516 aa  356  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 525 aa  356  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.92 
 
 		 515 aa  355  6.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.19 
 
 		 505 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  50 
 
 		 406 aa  355  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  41.04 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  51.43 
 
 		 378 aa  352  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 509 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.19 
 
 		 522 aa  350  5e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 520 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  40.44 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  50.43 
 
 		 372 aa  346  6e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  35.29 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  39.12 
 
 		 516 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  39.19 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  38.25 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  48.13 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  38.25 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 524 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 518 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  39.09 
 
 		 509 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 527 aa  339  7e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 524 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  40.79 
 
 		 516 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  47.8 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  47.4 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  38.84 
 
 		 511 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  38.37 
 
 		 519 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 532 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 512 aa  336  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 512 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  38.52 
 
 		 524 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  38.65 
 
 		 514 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  38.49 
 
 		 521 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  38.72 
 
 		 515 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.37 
 
 		 520 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  39.33 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  38.34 
 
 		 521 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  38.05 
 
 		 556 aa  329  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  46.59 
 
 		 393 aa  329  7e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>