More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0025 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  66.8 
 
 		 516 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  73.33 
 
 		 511 aa  706    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  72.73 
 
 		 508 aa  707    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  75.29 
 
 		 509 aa  757    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 515 aa  1015    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  51.65 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.94 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  50.87 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  47.93 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  43.18 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  43.72 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  46.53 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  43.81 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.33 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  43.61 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.49 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  46.28 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  41.67 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  42.31 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  41.52 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  41.9 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.45 
 
 		 505 aa  362  6e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  38.96 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 		 500 aa  332  8e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  40.73 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.18 
 
 		 522 aa  312  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  40.95 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  41.34 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.12 
 
 		 525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 505 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  37.62 
 
 		 515 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 507 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  39.1 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  40.6 
 
 		 527 aa  297  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  38.91 
 
 		 514 aa  296  7e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  38.81 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  36.59 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  36.2 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  36.7 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  39.1 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  38.26 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  39.52 
 
 		 511 aa  290  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  37.5 
 
 		 515 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  38.81 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  39.21 
 
 		 517 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.58 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  37.03 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  37.9 
 
 		 515 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 511 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  39.26 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  37.4 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  38.39 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  37.97 
 
 		 521 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  37.16 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  38.87 
 
 		 515 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 506 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 506 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  37.82 
 
 		 505 aa  283  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  42.7 
 
 		 406 aa  283  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  35.05 
 
 		 510 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  37.92 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  38.52 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  36.47 
 
 		 530 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  37.01 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  38.75 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  36.86 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  37.7 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  37.65 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  37.62 
 
 		 540 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  35.65 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  36.58 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  37.72 
 
 		 506 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  37.62 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  41.37 
 
 		 387 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  38.35 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  36.44 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  36.8 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  37.94 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  37.95 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  36.56 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  37.52 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  35.91 
 
 		 505 aa  277  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  38.32 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  38.22 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  40.37 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  38 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  37.94 
 
 		 505 aa  276  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  38.71 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.13 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>