More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1596 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 514 aa  1035    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  84.41 
 
 		 514 aa  897    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  97.08 
 
 		 514 aa  1008    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  97.47 
 
 		 514 aa  1014    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  70.96 
 
 		 514 aa  770    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  51.11 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  49.9 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  48.59 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  47.98 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  47.79 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  47.77 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  47.19 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  46.99 
 
 		 492 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.38 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  50 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  48.56 
 
 		 483 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  49.19 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  45.47 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  46.22 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.64 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.1 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  46.04 
 
 		 522 aa  430  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  44.81 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  45.47 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  45.6 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  44.84 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  45 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  45.4 
 
 		 521 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  44.47 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  44.62 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  45.06 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  44.44 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  46.17 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  43.79 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  43.98 
 
 		 532 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  44.25 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  45.22 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  43.23 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  43.25 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  43.45 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  43.11 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  43.55 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.87 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  43.5 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  42.31 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  46.05 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  43.25 
 
 		 509 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  42.63 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  50.13 
 
 		 394 aa  392  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  42.38 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  45.08 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  42.21 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  41 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  43.63 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  42.52 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  42.18 
 
 		 523 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  43 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  41.98 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  41.98 
 
 		 523 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  49.38 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  42.94 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  42.63 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  43.08 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  42.57 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  40.86 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  41.09 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  40.88 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  52.82 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  42.23 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  40.67 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  40.47 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40.84 
 
 		 514 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  42.32 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  42.46 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  42.2 
 
 		 530 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>