More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0711 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  72.14 
 
 		 483 aa  705    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 485 aa  974    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  66.45 
 
 		 460 aa  624  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  57.53 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  59.79 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  58.76 
 
 		 503 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  55.94 
 
 		 492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  58.54 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  54.92 
 
 		 492 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  55.12 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  54.3 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  54.3 
 
 		 492 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  58.97 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 514 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  52.69 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  50.51 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  49.39 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  49.69 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  51.53 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  51.55 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  51.65 
 
 		 515 aa  465  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  51.45 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  47.95 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  44.99 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.73 
 
 		 505 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  43.83 
 
 		 491 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  45.34 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  43.21 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  43.75 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  43.35 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  45.18 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  43.82 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  43.26 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  41.53 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  42.97 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  43.26 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.92 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.38 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  42.57 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  42.48 
 
 		 509 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  42.77 
 
 		 512 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  41.77 
 
 		 509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  42.14 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  42.05 
 
 		 508 aa  359  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  41.77 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.4 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 499 aa  355  8.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  40.56 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  42.37 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  41.94 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.96 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 524 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 524 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 515 aa  349  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  41.4 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  40.97 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  40.16 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 511 aa  347  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  41.18 
 
 		 516 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  39.52 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  39.8 
 
 		 532 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  39 
 
 		 523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  38.18 
 
 		 524 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  41.36 
 
 		 536 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  41.32 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  39.76 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  40.76 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  40.81 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  38.45 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  38.4 
 
 		 521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 527 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  46.85 
 
 		 406 aa  340  4e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  39.39 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  40.88 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  40.2 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  48.06 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  41.4 
 
 		 513 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  40.5 
 
 		 531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  39.19 
 
 		 511 aa  336  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 515 aa  336  5.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  40.5 
 
 		 530 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  39.81 
 
 		 541 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  40.6 
 
 		 522 aa  333  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  40.93 
 
 		 513 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  48.49 
 
 		 378 aa  333  6e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  40.64 
 
 		 524 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  40.23 
 
 		 541 aa  332  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  37.88 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>