More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0109 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  100 
 
 		 460 aa  919    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  66.45 
 
 		 485 aa  624  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  64.13 
 
 		 483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  60.26 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  59.02 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  57.36 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  55.53 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  54.45 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  59.56 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  54.66 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  54.23 
 
 		 492 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  60.18 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  54.01 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  50.43 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  50.22 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  49.78 
 
 		 514 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  51.3 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  51.65 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  51.31 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  50.87 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  49.78 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.65 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  44.14 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  46.57 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  43.51 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.89 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  42.92 
 
 		 490 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.95 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  50.44 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  42.68 
 
 		 509 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  48.8 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  42.61 
 
 		 505 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  49.25 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.29 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 511 aa  329  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  50.45 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  40.72 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.54 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  40.38 
 
 		 521 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  41.68 
 
 		 515 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.44 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  40.84 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  41.89 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  44.06 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  39.5 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  42.92 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  41.68 
 
 		 516 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  39.5 
 
 		 505 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  40.93 
 
 		 519 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 516 aa  316  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 515 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  41.29 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  40.04 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  41.42 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  46.76 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  38.34 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 524 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  40.13 
 
 		 511 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  40.25 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  47.97 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  38.85 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  39.49 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  39.19 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  41.06 
 
 		 512 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  38.9 
 
 		 524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  38.17 
 
 		 515 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  38.98 
 
 		 513 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 518 aa  309  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  39.66 
 
 		 507 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  38.9 
 
 		 524 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 519 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  40.6 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  38.97 
 
 		 520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  39.45 
 
 		 527 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  38.04 
 
 		 522 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.21 
 
 		 507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  42.22 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  40.63 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.51 
 
 		 347 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40.38 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  39.92 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  38.76 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  40.55 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  45.75 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  38.59 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  39.91 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  39.36 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  38.77 
 
 		 532 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  39.28 
 
 		 514 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 520 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  40.17 
 
 		 505 aa  296  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 516 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  39.23 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>