More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0633 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 376 aa  761    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  63.34 
 
 		 376 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  58.87 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  58.58 
 
 		 393 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  63.78 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  53.48 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  53.01 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  52.73 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  45.17 
 
 		 514 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  45.17 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  44.89 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  43.47 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  44.6 
 
 		 514 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  47.14 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.44 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  45.24 
 
 		 492 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  44.93 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  44.93 
 
 		 492 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  44.51 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  44.8 
 
 		 492 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.75 
 
 		 406 aa  311  9e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  46.22 
 
 		 500 aa  309  5e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.45 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  45.61 
 
 		 485 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.4 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  42.93 
 
 		 386 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  42.54 
 
 		 386 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  42.27 
 
 		 386 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  45.01 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  46.57 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 386 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  39.39 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  45.35 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 502 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.59 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  44.01 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  43.48 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  45.22 
 
 		 504 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  43.7 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  47.01 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 489 aa  292  8e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  44.16 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  44.13 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  47.04 
 
 		 503 aa  289  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.33 
 
 		 500 aa  288  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  42.61 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  43.16 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  43.41 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  43.29 
 
 		 372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  43.39 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  44.66 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  41.76 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  42.78 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  43.25 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  43.96 
 
 		 377 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  43.66 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  40.73 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  41.05 
 
 		 393 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  45.57 
 
 		 460 aa  275  8e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  41.6 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  43.4 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  43.35 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  40.66 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  40.11 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  42.45 
 
 		 522 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  42.74 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  41.33 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  43.97 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  46.39 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  42.03 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 508 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 513 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  39.08 
 
 		 503 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  40.86 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  43.14 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  40.58 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.97 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  43.68 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  43.02 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  42.49 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 507 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  42.9 
 
 		 516 aa  266  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.71 
 
 		 504 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.38 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  42.49 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  41.09 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  43.68 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  43.31 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  38.46 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  45.56 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  41.53 
 
 		 518 aa  262  6e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  42.82 
 
 		 479 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  37.77 
 
 		 515 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  43.52 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  40.21 
 
 		 506 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  41.3 
 
 		 528 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  41.62 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>