More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1957 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  100 
 
 		 461 aa  927    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  80.22 
 
 		 460 aa  780    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  57.95 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  57.24 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  57.69 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  56.01 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  40.05 
 
 		 514 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  41.42 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.68 
 
 		 389 aa  296  7e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  38.54 
 
 		 514 aa  295  9e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.1 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  38.52 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  43.43 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  38.05 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  41.64 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  42.54 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.33 
 
 		 382 aa  279  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.89 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  41.76 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  42.29 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  40.06 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  40.86 
 
 		 378 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.98 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  41.6 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  41.08 
 
 		 393 aa  273  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  39.52 
 
 		 511 aa  269  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  39.78 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  36.56 
 
 		 504 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.52 
 
 		 492 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  38.87 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  40.51 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  38.89 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  40.51 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  37.77 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  39.49 
 
 		 377 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  37 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  39.49 
 
 		 385 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  38.89 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  36.73 
 
 		 492 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.27 
 
 		 492 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  40.11 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  37.43 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  39.37 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  37.14 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  36.41 
 
 		 485 aa  255  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  40.77 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  39.01 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.66 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.66 
 
 		 386 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 511 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  38.73 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  39.78 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36.73 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  38.73 
 
 		 513 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  36.54 
 
 		 515 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  39.37 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  38.64 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  39.27 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  35.06 
 
 		 516 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.63 
 
 		 504 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  38.42 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  37.78 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  37.79 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  37.08 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  37.25 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  37.4 
 
 		 499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  37.3 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  39.2 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  36.56 
 
 		 515 aa  243  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  36.81 
 
 		 515 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  35.56 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  34.38 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  37.85 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  38.48 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  37.6 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 516 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  36.22 
 
 		 503 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  40.11 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.92 
 
 		 347 aa  240  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  39.24 
 
 		 392 aa  240  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 509 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 509 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  35.91 
 
 		 505 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  36.64 
 
 		 509 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  38.81 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  35.41 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  33.69 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  35.37 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  35.37 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  37.47 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  37.61 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  35.85 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  38.48 
 
 		 521 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  38.29 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  37.09 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  36.76 
 
 		 382 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>