More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0826 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  87.81 
 
 		 448 aa  804    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  86.2 
 
 		 489 aa  790    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 448 aa  901    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  89.86 
 
 		 475 aa  822    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  57.6 
 
 		 460 aa  514  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  56.01 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  42.42 
 
 		 406 aa  282  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  42.46 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  42.62 
 
 		 372 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  40.22 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  37.34 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  38.22 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.84 
 
 		 394 aa  253  7e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  37.6 
 
 		 514 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  37.89 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  37.98 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  39.44 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  39.22 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  38 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  38.31 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  40.36 
 
 		 376 aa  236  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  37.96 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  38.94 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  38.25 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  35.1 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  36.72 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  39.94 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  35.62 
 
 		 492 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  38.03 
 
 		 385 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  37.43 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39 
 
 		 522 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  35.64 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  38.59 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  34.67 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  38.68 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  34.41 
 
 		 479 aa  226  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36.24 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  34.81 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  34.81 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  36.8 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  36.46 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  37.16 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  39.34 
 
 		 393 aa  223  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  40.3 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  36.13 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  37.09 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  35.18 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  36.06 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  35.57 
 
 		 386 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  35.31 
 
 		 511 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.62 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  34.07 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.84 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  39.27 
 
 		 398 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  36.74 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  37.27 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  34.92 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  31.03 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  36.34 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  34 
 
 		 539 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  35.26 
 
 		 513 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  34 
 
 		 539 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  35.67 
 
 		 517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  37 
 
 		 546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  31.81 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  37.5 
 
 		 546 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  35.01 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  37.13 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  38.03 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  35.06 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.11 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  36.21 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  37.17 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  36.77 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  35.86 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  34.75 
 
 		 525 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  32.51 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  37.53 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  37.78 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  34.31 
 
 		 382 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.63 
 
 		 389 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  33.9 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  34.43 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  34.97 
 
 		 503 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  33.61 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  36.26 
 
 		 378 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  32.31 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  34.6 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  33.61 
 
 		 500 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  37.35 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  36.42 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  36.34 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  34.6 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  34.52 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  34.65 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  32.89 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 506 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  32.82 
 
 		 536 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>