More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0598 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 376 aa  772    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  62.2 
 
 		 388 aa  477  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  63.34 
 
 		 376 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  67.86 
 
 		 377 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  58.18 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  53.42 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  52.57 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  52.41 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.16 
 
 		 514 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  47.16 
 
 		 514 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  46.59 
 
 		 514 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 		 514 aa  324  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  44.2 
 
 		 386 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  44.63 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  43.65 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  43.3 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  45.09 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.73 
 
 		 505 aa  298  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  42.2 
 
 		 492 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  43.48 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  42.42 
 
 		 504 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  44.64 
 
 		 492 aa  296  4e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.37 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  41.42 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.93 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  43.68 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  41.69 
 
 		 492 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  41.46 
 
 		 500 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  42.45 
 
 		 483 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  46.93 
 
 		 490 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  42.35 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  44 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  41.69 
 
 		 503 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.51 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  40.7 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  42.17 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  41.16 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  42.82 
 
 		 377 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  40.33 
 
 		 516 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  41.64 
 
 		 377 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  41.18 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  42.46 
 
 		 522 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  39.95 
 
 		 387 aa  268  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  42.74 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  41.64 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  43.14 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  41.21 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  41.37 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  41.37 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  42.61 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  40.68 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.38 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  40.56 
 
 		 508 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  40.98 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  39.26 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  40.53 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  40.32 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  40.74 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.31 
 
 		 504 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  42.45 
 
 		 489 aa  260  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  41.55 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  41.91 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  42.05 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  41.77 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  39.72 
 
 		 511 aa  259  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 506 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.53 
 
 		 507 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  39.89 
 
 		 500 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  41.09 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  39.57 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.49 
 
 		 496 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 506 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 506 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 506 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  39.89 
 
 		 500 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  40.8 
 
 		 511 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  39.66 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 506 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  39.62 
 
 		 500 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  44.1 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.81 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  41.62 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  39.41 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  38.55 
 
 		 515 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  38.68 
 
 		 515 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  39.11 
 
 		 516 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  38.71 
 
 		 475 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  39.58 
 
 		 509 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  41.13 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 509 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  41.26 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 509 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>