More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1153 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 
386 aa  793    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  87.01 
 
 
386 aa  707    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  96.11 
 
 
386 aa  765    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  96.11 
 
 
386 aa  766    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  74.87 
 
 
387 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 
514 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49.59 
 
 
514 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 
514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  48.47 
 
 
514 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 
514 aa  356  5e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  47.06 
 
 
393 aa  340  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  47.92 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  47.67 
 
 
492 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  45.57 
 
 
389 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  46.72 
 
 
492 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  45.71 
 
 
502 aa  328  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  46.61 
 
 
492 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.28 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  46.3 
 
 
492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  46.3 
 
 
492 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  44.59 
 
 
504 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  44.78 
 
 
485 aa  323  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.18 
 
 
505 aa  322  6e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 
500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  44.11 
 
 
376 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.81 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.53 
 
 
389 aa  317  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  45.38 
 
 
382 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.01 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  45.98 
 
 
388 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  43.49 
 
 
483 aa  308  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.96 
 
 
500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.48 
 
 
372 aa  298  8e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  42.51 
 
 
378 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  42.23 
 
 
503 aa  296  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  43.72 
 
 
393 aa  296  6e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 
380 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  42.53 
 
 
385 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  42.45 
 
 
381 aa  292  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 
381 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  40.97 
 
 
382 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  42.44 
 
 
386 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.9 
 
 
387 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  42.82 
 
 
388 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  44.18 
 
 
503 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  40.57 
 
 
382 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  42.27 
 
 
376 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  42.99 
 
 
383 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  40.68 
 
 
377 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  40 
 
 
390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 
522 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.62 
 
 
504 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  40.05 
 
 
438 aa  282  9e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  39.74 
 
 
524 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 
527 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  39.47 
 
 
383 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  39.48 
 
 
524 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.02 
 
 
491 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  41.87 
 
 
520 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  39.73 
 
 
524 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 
521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  39.19 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  42.37 
 
 
532 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  40.41 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 
520 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  39.4 
 
 
490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 
520 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 
521 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.26 
 
 
496 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.02 
 
 
347 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  39.15 
 
 
387 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  44.27 
 
 
507 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  40.53 
 
 
520 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 
520 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  39.36 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  38.15 
 
 
446 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 
532 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  40.41 
 
 
460 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 
519 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 
507 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  40.24 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.93 
 
 
509 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.55 
 
 
515 aa  266  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  39.7 
 
 
400 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  42.04 
 
 
517 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  40.53 
 
 
523 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  39.52 
 
 
515 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  38.81 
 
 
479 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  38.68 
 
 
382 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  39.89 
 
 
460 aa  263  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.21 
 
 
509 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  39.94 
 
 
383 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  41.27 
 
 
525 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.64 
 
 
514 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  39.03 
 
 
526 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  40.1 
 
 
519 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  38.86 
 
 
377 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  40.21 
 
 
520 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  37.53 
 
 
508 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>