More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2059 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 489 aa  991    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  85.97 
 
 		 448 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  86.2 
 
 		 448 aa  790    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  84.5 
 
 		 475 aa  816    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  58.61 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  57.95 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.77 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.62 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.57 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  43.56 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  44.57 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  38.78 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.08 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  38.35 
 
 		 514 aa  273  7e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  38.28 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  39.81 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  41.13 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  39.27 
 
 		 514 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  41.55 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  40.71 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  37.08 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.93 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  37.7 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.08 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  39.52 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  40.43 
 
 		 522 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  42.45 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  39.11 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  39.53 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.18 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  37.97 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  38.24 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  38.89 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.64 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  40.4 
 
 		 405 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  41.29 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  42.42 
 
 		 377 aa  257  4e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  40.45 
 
 		 385 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  39.58 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.56 
 
 		 504 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  38.92 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  34.93 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.87 
 
 		 500 aa  256  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  38.71 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  37.95 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  41.41 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  38.92 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  39.48 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.62 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  37.89 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  37.05 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  37.37 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  36.08 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  36.08 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  36.16 
 
 		 503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  38.6 
 
 		 383 aa  245  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  39.69 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  38.69 
 
 		 546 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  36.08 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  37.61 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  35.54 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  38.56 
 
 		 513 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  39 
 
 		 460 aa  239  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  37.73 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  38.19 
 
 		 546 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  38.44 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  36.44 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  36.6 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  38.13 
 
 		 536 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  38.67 
 
 		 377 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  39.9 
 
 		 505 aa  237  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  37.06 
 
 		 483 aa  236  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  39.16 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  35.8 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  37.96 
 
 		 521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  37.86 
 
 		 518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  38.96 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  37.14 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  41.24 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  37.63 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  37.37 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  38.4 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  37.01 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  37.63 
 
 		 528 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  35.75 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  38.18 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  34.94 
 
 		 509 aa  230  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  37.71 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  35.34 
 
 		 515 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  37.08 
 
 		 511 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  38.79 
 
 		 540 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  39.5 
 
 		 407 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  36.86 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.86 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  36.24 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  36.39 
 
 		 536 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  36.39 
 
 		 536 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  38.46 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  38.07 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>