More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2918 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 407 aa  835    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  58.06 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  58.22 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  58.44 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  56.73 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  58.58 
 
 		 515 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  56.92 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  58.58 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  57.81 
 
 		 519 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  51.83 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55.41 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  57.44 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 		 505 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.16 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.95 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  53.57 
 
 		 522 aa  431  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  54.5 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.16 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  55.87 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  55.61 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  55.21 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  55.26 
 
 		 509 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 527 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.54 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  56.1 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  54.83 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  54.86 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  54.31 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  55.01 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  53.94 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  55.41 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  55.15 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 524 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 515 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  56.43 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.97 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.43 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  54.86 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  56.69 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  53.3 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 529 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  53.25 
 
 		 514 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  52.74 
 
 		 529 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  54.86 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 512 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  53.25 
 
 		 521 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  52.69 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  53.58 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  55.2 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  56 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  54.15 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  55.2 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  53.81 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  50.76 
 
 		 520 aa  411  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  53.57 
 
 		 523 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 527 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  53.58 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  55.12 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 523 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 515 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  52.02 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  54.26 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  55.12 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  53.81 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>