More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1293 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 393 aa  804    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  40.34 
 
 		 492 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  40.52 
 
 		 514 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  38.87 
 
 		 514 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  38.4 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  41.89 
 
 		 460 aa  272  6e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.2 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  41.49 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  39.11 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.49 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  38.6 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.71 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.36 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  40.71 
 
 		 489 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  39.41 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.42 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  37.87 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  39.22 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  37.93 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  39.82 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.53 
 
 		 485 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  37.39 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  40.11 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  37.11 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  38.22 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  38.04 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  38.51 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  38.32 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  38.33 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  37.72 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  39.94 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  38.2 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  39.5 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  39.63 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  43.52 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  39.72 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  38.11 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  38.37 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  38.86 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  35.82 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  37.19 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  36.34 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  36.21 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  37.36 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  37.74 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  37.79 
 
 		 483 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  38.14 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  37.32 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  35.53 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  35.75 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  35.96 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  32.86 
 
 		 522 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  36.81 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  32.61 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  32.61 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  38.94 
 
 		 516 aa  222  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  33.15 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  33.53 
 
 		 438 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  35.4 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  37.92 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.81 
 
 		 500 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.27 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  36.81 
 
 		 398 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  34.42 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  34.11 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  36.22 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  35.34 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  36.47 
 
 		 503 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  33.53 
 
 		 446 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  35.69 
 
 		 442 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1102  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  37.98 
 
 		 526 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  35.91 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  34.29 
 
 		 451 aa  209  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  35.33 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  34.77 
 
 		 391 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  36.02 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.38 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  33.24 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  33.64 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  35.33 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  36.23 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  32.16 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  33.43 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  32.63 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  36.02 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.06 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  34.8 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  31.56 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  32.36 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  32.36 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  37.76 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  34.57 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  34.19 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  35.02 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  34.53 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  32.74 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  31.78 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>