More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2761 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  100 
 
 		 391 aa  799    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  58.97 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  57.37 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  58.49 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  57.1 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  57.1 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  56.79 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  54.96 
 
 		 376 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  59.13 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  55.61 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  55.26 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  55.97 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  54.45 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  37.37 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  37.2 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  36.94 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  36.26 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  36.68 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  39.6 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  38.07 
 
 		 489 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  36.29 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  35.83 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  39.08 
 
 		 376 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  34.87 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  35.95 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  39.6 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  36.1 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  34.44 
 
 		 514 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  35.69 
 
 		 514 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  35.23 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  36.87 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  33.89 
 
 		 514 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  33.89 
 
 		 514 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  34.77 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  33.99 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  35.22 
 
 		 448 aa  205  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  32.89 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  34.7 
 
 		 500 aa  202  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  35.57 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  33.24 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  34.52 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  35.38 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  35.44 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  33.15 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  34.33 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  34.48 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.69 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  33.16 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  33.7 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.84 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  34.44 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  32.76 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  32.29 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  34.48 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  33.07 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  34.41 
 
 		 442 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  32.94 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.43 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  32.96 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  32.53 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  34.89 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  36.01 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  32.84 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  30.03 
 
 		 377 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  30.89 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  31.25 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  33.87 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  33.24 
 
 		 522 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  32.8 
 
 		 377 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  32.66 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  32.66 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  32.21 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  32.67 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  32.08 
 
 		 503 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  33.79 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  32.09 
 
 		 492 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  32.79 
 
 		 522 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  33.69 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  33.06 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  32.96 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  32.52 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.73 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  35.6 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  33.24 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  32.76 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  32.96 
 
 		 504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  31.82 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  31.23 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  34.68 
 
 		 525 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  32.79 
 
 		 523 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  31.82 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  32.25 
 
 		 522 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  32.96 
 
 		 520 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  32.96 
 
 		 520 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  32.96 
 
 		 520 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  32.25 
 
 		 522 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>