More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0385 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00076  2-isopropylmalate synthase  66.8 
 
 		 523 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3524  2-isopropylmalate synthase  66.8 
 
 		 523 aa  715    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  68.77 
 
 		 532 aa  719    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  69.73 
 
 		 515 aa  738    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  66.73 
 
 		 526 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  95.79 
 
 		 522 aa  1037    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  59.57 
 
 		 511 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0079  2-isopropylmalate synthase  66.99 
 
 		 523 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  68.58 
 
 		 532 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  72.21 
 
 		 515 aa  759    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0129  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0129  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  71.43 
 
 		 544 aa  751    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  70.08 
 
 		 520 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0125  2-isopropylmalate synthase  67.18 
 
 		 523 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.16499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  68.22 
 
 		 525 aa  721    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  87.19 
 
 		 523 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0077  2-isopropylmalate synthase  66.99 
 
 		 523 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  67.25 
 
 		 524 aa  718    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  87.95 
 
 		 523 aa  952    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  70.08 
 
 		 520 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  72.21 
 
 		 516 aa  762    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0122  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.624748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0334  2-isopropylmalate synthase  84.87 
 
 		 522 aa  899    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  99.43 
 
 		 522 aa  1072    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  99.43 
 
 		 522 aa  1072    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  68.99 
 
 		 519 aa  743    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0079  2-isopropylmalate synthase  66.8 
 
 		 523 aa  715    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  67.19 
 
 		 517 aa  712    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  95.98 
 
 		 522 aa  1038    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  95.59 
 
 		 522 aa  1034    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0081  2-isopropylmalate synthase  66.99 
 
 		 523 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  88.12 
 
 		 522 aa  952    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 522 aa  1078    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00075  hypothetical protein  66.8 
 
 		 523 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3583  2-isopropylmalate synthase  66.99 
 
 		 523 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0622  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  725    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  99.62 
 
 		 522 aa  1075    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  99.43 
 
 		 522 aa  1072    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  87.57 
 
 		 523 aa  946    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  95.79 
 
 		 522 aa  1037    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0124  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.041588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  89.85 
 
 		 522 aa  961    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  71.4 
 
 		 519 aa  763    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  68.88 
 
 		 515 aa  735    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  70.08 
 
 		 520 aa  758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  59.3 
 
 		 511 aa  634    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  91.01 
 
 		 523 aa  977    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  68.86 
 
 		 524 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0068  2-isopropylmalate synthase  66.99 
 
 		 523 aa  717    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1889  2-isopropylmalate synthase  59.3 
 
 		 511 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.1 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 532 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.1 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  51.01 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 517 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 508 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 515 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 536 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 515 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 536 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.82 
 
 		 522 aa  475  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 516 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  47.83 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  50.61 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  47.59 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  48.26 
 
 		 527 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  48.04 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 536 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  51.01 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>