More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3603 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 375 aa  759    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  58.49 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  58.9 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  51.12 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  50.27 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  49.47 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  51.5 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  51.64 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  51.64 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  50.96 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  51.37 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  51.37 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  47.48 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  36.9 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  36.16 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  32.33 
 
 		 514 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  32.79 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  34.44 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  32.33 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.34 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  33.62 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  34.55 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  32.07 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  31.18 
 
 		 502 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  33.81 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  32.58 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  32.4 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  33.14 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  33.24 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.34 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  33.24 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  32.7 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  33.24 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  32.16 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  32.56 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  32.97 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  36.08 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.73 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  33.43 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  31.1 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.27 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  33.24 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  32.86 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  34.52 
 
 		 519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  31.7 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  36.44 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  31.78 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  33.63 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  28.68 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  32.75 
 
 		 394 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  33.05 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  32.4 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  29.73 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  33.9 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  36.31 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  30.25 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  30.86 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  32.99 
 
 		 521 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  31.23 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  32.86 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  33.5 
 
 		 520 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  30.59 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  33.5 
 
 		 520 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  32.77 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  28.37 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  30.75 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  32.72 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  31.32 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  31.95 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  32.91 
 
 		 520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  33.16 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  31.99 
 
 		 490 aa  166  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  32.39 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  31.12 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  32.57 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  29.51 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  31.61 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  31.64 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  32.36 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  30.56 
 
 		 507 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  29.95 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  32.84 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  30.91 
 
 		 505 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  35.94 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  30.11 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  30.54 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  31.62 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  30.59 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  30.13 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  31.61 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  30.81 
 
 		 523 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  30.29 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  30.29 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.77 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  30.46 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  30.75 
 
 		 518 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  30.68 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  30.53 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>