More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2729 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  81.22 
 
 		 413 aa  702    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 412 aa  850    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  33.7 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  32.88 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  36.25 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  32.6 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  29.59 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  32.77 
 
 		 375 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  32.06 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  30.22 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  30.87 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  30.4 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  31.5 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  30.39 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  30.11 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  30.11 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  29.1 
 
 		 532 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  30.08 
 
 		 536 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  30.08 
 
 		 536 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  29.95 
 
 		 525 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  30.48 
 
 		 508 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  30.89 
 
 		 528 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  31.66 
 
 		 511 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  31.17 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  28.99 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  30.77 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  30.89 
 
 		 516 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  29.74 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3757  2-isopropylmalate synthase  32.3 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  30.11 
 
 		 516 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  30.08 
 
 		 519 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  29.65 
 
 		 556 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  29.65 
 
 		 556 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  29.43 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  30.39 
 
 		 513 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  30.1 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  29.09 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  30.29 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  30.11 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  30.58 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  29.63 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  30.13 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  29.29 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  30.66 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  30.48 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  29.44 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  30.26 
 
 		 511 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  29.05 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  30.79 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  31.2 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  32.21 
 
 		 515 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  29.76 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  27.23 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  30.9 
 
 		 516 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  29.57 
 
 		 514 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  31.08 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  29.03 
 
 		 512 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  30.36 
 
 		 513 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  26.98 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  28.29 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  27.81 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  27.81 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  27.81 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  27.82 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  29.06 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  30.75 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  28.03 
 
 		 515 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  28.42 
 
 		 505 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0622  2-isopropylmalate synthase  28.37 
 
 		 523 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  30.22 
 
 		 516 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  27.65 
 
 		 518 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  30.22 
 
 		 511 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  30.25 
 
 		 513 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  28.23 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  28.17 
 
 		 541 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  28.72 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  29.97 
 
 		 513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  31.07 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  29.03 
 
 		 531 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  31.94 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  28.37 
 
 		 525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  29.14 
 
 		 520 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  32.2 
 
 		 516 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  30.29 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  27.83 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  28.86 
 
 		 546 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  28.07 
 
 		 536 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  28.26 
 
 		 532 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02609  2-isopropylmalate synthase  29.6 
 
 		 491 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  27.53 
 
 		 522 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  28.09 
 
 		 532 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  27.96 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  27.47 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  27.81 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  27.96 
 
 		 505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  29.98 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  28.07 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  28.86 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  28.12 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>