More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3757 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3757  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 462 aa  954    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48570  putative 2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251079  normal  0.0168935 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4159  isopropylmalate/homocitrate synthase  47.84 
 
 		 336 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  39.43 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  39.24 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  37.58 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  36.5 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  37.79 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  35.29 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  35.92 
 
 		 514 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  35.92 
 
 		 514 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  36.36 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  36.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  37.3 
 
 		 503 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  36.27 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  35.28 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  34.38 
 
 		 517 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  35.57 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  34.63 
 
 		 514 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  37.27 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  34.41 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  32.76 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  34.71 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  36.05 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  32.58 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  34.97 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  34.42 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  34.93 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  34.74 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  34.42 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.8 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  34.52 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  35.83 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  35.44 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.81 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.89 
 
 		 505 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  35.85 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  33.73 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  36.71 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  31.39 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  30.61 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  36.27 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  33.54 
 
 		 505 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  34.73 
 
 		 502 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.75 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  32.26 
 
 		 504 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  34.17 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  33.33 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  34.48 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  37.01 
 
 		 387 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  34.38 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  33.03 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  35.4 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  33.01 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  34.8 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.28 
 
 		 496 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  34.17 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  30.86 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  34.48 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  32.4 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  33.55 
 
 		 492 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  31.91 
 
 		 524 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  33.44 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  34.28 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  34.2 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  33.95 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  35.16 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  33.74 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  33.44 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  35.03 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  33.44 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  33.96 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  31.3 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  34.46 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  31.62 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  36.75 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  33.02 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  32.3 
 
 		 519 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  34.49 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  32.04 
 
 		 509 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  31.9 
 
 		 376 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  32.04 
 
 		 509 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  32.48 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  32.48 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  34.47 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  32.58 
 
 		 520 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  32.91 
 
 		 492 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  34.95 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  32.58 
 
 		 492 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  34.06 
 
 		 568 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  34.6 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  33.02 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  32.09 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  32.26 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  30.51 
 
 		 524 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  34.63 
 
 		 381 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>