More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48570  putative 2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 455 aa  932    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251079  normal  0.0168935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3757  2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4159  isopropylmalate/homocitrate synthase  43.34 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  38.08 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  37.2 
 
 		 461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  31.87 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  32.3 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  33.55 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  34.63 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  35.74 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  33.44 
 
 		 388 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  32.18 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  31.91 
 
 		 448 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  32.9 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  33.86 
 
 		 409 aa  171  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  30.53 
 
 		 514 aa  170  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  30.53 
 
 		 514 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  30.71 
 
 		 504 aa  170  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  30.53 
 
 		 514 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  30.22 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  30.53 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  35.41 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  32.05 
 
 		 405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  31 
 
 		 502 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  35.14 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  30.67 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  32.36 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  31.93 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  29.19 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  30.99 
 
 		 382 aa  163  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.7 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  33.44 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  29.75 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  33.13 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  30.43 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 382 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  31.68 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  31.25 
 
 		 385 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  31.8 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  31.48 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  36.28 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  31.73 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  31.8 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  31.29 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  31.17 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  32.86 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  34.66 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  33.14 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  31.06 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  32.72 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  30.55 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.86 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  34.77 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  32.5 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  33.77 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  30.97 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.25 
 
 		 500 aa  156  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  30 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  32.39 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  34.36 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  30.97 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  30.86 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  32.35 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  33.88 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  33.54 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  32.35 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  33.44 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  31.33 
 
 		 522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  31.33 
 
 		 515 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  33.44 
 
 		 389 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  31.4 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  31.58 
 
 		 381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  33.44 
 
 		 523 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  34.11 
 
 		 491 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  30.7 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  33.88 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  31.86 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  29.35 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  32.37 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  31.99 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  29.22 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  32.8 
 
 		 522 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  32.58 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  31.74 
 
 		 523 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  34.21 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  31.73 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  31.8 
 
 		 515 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  33.55 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  31.85 
 
 		 544 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  31.65 
 
 		 509 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  31.65 
 
 		 509 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  32.8 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  32.18 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  30.79 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  32.4 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  32.6 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  32.34 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>