More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1986 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 503 aa  1033    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  77.37 
 
 		 387 aa  621  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5897  pyruvate carboxyltransferase  72.87 
 
 		 379 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3670  pyruvate carboxyltransferase  70.74 
 
 		 384 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0979499  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  69.41 
 
 		 386 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 519 aa  501  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  48.6 
 
 		 522 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 523 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 522 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  47.39 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  48.61 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  47.4 
 
 		 541 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 522 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  48.51 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  48.08 
 
 		 536 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  48.13 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  47.94 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  46.73 
 
 		 536 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 544 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  48.12 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  46.73 
 
 		 536 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  48.41 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 522 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0334  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  47.42 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  46.15 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  46.15 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  46.55 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 		 556 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  48.41 
 
 		 505 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  48.02 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  47.83 
 
 		 519 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  46.83 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  45.04 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 525 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  46.99 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  48.52 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  46.63 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  47.81 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  46.2 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2865  pyruvate carboxyltransferase  59.79 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.134152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  46.93 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  46.73 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 556 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  47.47 
 
 		 531 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  46.83 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  46.91 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  46.34 
 
 		 523 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  46.41 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  48.42 
 
 		 517 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  47.42 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00076  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3524  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  46.14 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  47.19 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  45.62 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  45.83 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  45.63 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00075  hypothetical protein  47.49 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  46.53 
 
 		 515 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  46.71 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  46.92 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0077  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0079  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  47.34 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3583  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>