More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2865 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2865  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 393 aa  806    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.134152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  62.37 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5897  pyruvate carboxyltransferase  62.5 
 
 		 379 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3670  pyruvate carboxyltransferase  62.8 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0979499  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  59.79 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3741  2-isopropylmalate synthase  61.27 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  63.4 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  58.53 
 
 		 513 aa  431  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  53.81 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 525 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2011  pyruvate carboxyltransferase  56.99 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000219669  normal  0.234944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  52.53 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.25 
 
 		 505 aa  411  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.25 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  52.63 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  51.77 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  51.77 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.51 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.73 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  51.33 
 
 		 528 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  51.94 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  52.66 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  49.74 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  52.36 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 556 aa  391  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  49.48 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  52.25 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3171  2-isopropylmalate synthase  50.66 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  50.65 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 		 526 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  51.67 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.02 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  50.65 
 
 		 512 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 663 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  51.65 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00076  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3524  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  48.55 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  49.49 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0081  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00075  hypothetical protein  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  50.64 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 523 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 		 524 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0077  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0079  2-isopropylmalate synthase  52.66 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  50.27 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 523 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0079  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0068  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3583  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  49.23 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  49.74 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0129  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 523 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  51.52 
 
 		 530 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.66 
 
 		 514 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.87 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.92 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>