More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3171 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3171  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 505 aa  1038    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  46.73 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  45.94 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  46.12 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 		 509 aa  448  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  45.92 
 
 		 532 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  44.05 
 
 		 505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  45.63 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  43.85 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  47.41 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  46.64 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  43.85 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  45.11 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  45.13 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  46.32 
 
 		 509 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  43.43 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  45.45 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 524 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  42.89 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  44.18 
 
 		 524 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  44.18 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  44.11 
 
 		 511 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  43.81 
 
 		 522 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  43.79 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  43.54 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  43.68 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  43.11 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  42.17 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  43.28 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  43.71 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  44.64 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  43.71 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  42.71 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  43.71 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.42 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  43.11 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  43.4 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  44.05 
 
 		 518 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  42.57 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  41.15 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  43.34 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  42.06 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  42.51 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  42.72 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  42.77 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  42.71 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  43.68 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  42.72 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  41.86 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  43.51 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  41.88 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  42.29 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  44.31 
 
 		 523 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  43.2 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 523 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  41.75 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  42.28 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  43.08 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  42.48 
 
 		 510 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  41.65 
 
 		 522 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  42.41 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  43.09 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  42.32 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  41.85 
 
 		 523 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  42.32 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  41.05 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  41.48 
 
 		 544 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5897  pyruvate carboxyltransferase  52.65 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  42.6 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  43.14 
 
 		 513 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  41.45 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  41.08 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  41.4 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  42.69 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3424  pyruvate carboxyltransferase  51.59 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0602877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  41.35 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  41.28 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3670  pyruvate carboxyltransferase  52.08 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0979499  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  41.32 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  42.12 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  41.32 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  42.83 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>