More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0017 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  60.04 
 
 
520 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  98.24 
 
 
511 aa  1036    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1889  2-isopropylmalate synthase  99.02 
 
 
511 aa  1043    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  59.3 
 
 
522 aa  634    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  60.83 
 
 
516 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  60.04 
 
 
520 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  60.04 
 
 
520 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  60.16 
 
 
524 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  60.43 
 
 
515 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  59.84 
 
 
544 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  59.8 
 
 
522 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
511 aa  1050    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 
522 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 
522 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  59.3 
 
 
522 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  59.72 
 
 
522 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  59.22 
 
 
523 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  58.98 
 
 
517 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 
522 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 
522 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  58.9 
 
 
522 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  58.55 
 
 
523 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  59.01 
 
 
532 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  59.33 
 
 
522 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  59.22 
 
 
523 aa  628  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00076  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3524  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  58.19 
 
 
515 aa  624  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0079  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  58.81 
 
 
532 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0334  2-isopropylmalate synthase  59.14 
 
 
522 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0068  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0081  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  621  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  58.74 
 
 
522 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  58.35 
 
 
523 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  58.2 
 
 
519 aa  621  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3583  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00075  hypothetical protein  59.6 
 
 
523 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0077  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0124  2-isopropylmalate synthase  58.81 
 
 
523 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.041588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0122  2-isopropylmalate synthase  58.81 
 
 
523 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.624748  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0079  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
523 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.999327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0129  2-isopropylmalate synthase  58.81 
 
 
523 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0129  2-isopropylmalate synthase  58.61 
 
 
523 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0125  2-isopropylmalate synthase  58.81 
 
 
523 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.16499  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  57.99 
 
 
524 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  58.02 
 
 
525 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0622  2-isopropylmalate synthase  57.43 
 
 
523 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 
526 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  56.58 
 
 
519 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  57.62 
 
 
515 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  53.07 
 
 
511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  51.79 
 
 
514 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  52.31 
 
 
516 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 
516 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 
515 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 
517 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 
516 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 
514 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 
505 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 
532 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  52.59 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  49.3 
 
 
505 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 
505 aa  489  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 
505 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
513 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 
525 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 
513 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 
513 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 
515 aa  484  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 
513 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 
541 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 
504 aa  478  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 
511 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 
527 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 
514 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 
515 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 
521 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 
517 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 
512 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 
513 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  49.15 
 
 
531 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 
524 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 
516 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 
524 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  48.18 
 
 
536 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  48.72 
 
 
527 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 
519 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 
516 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  47.88 
 
 
536 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  47.13 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  47.4 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  47.19 
 
 
521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  48.07 
 
 
541 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  46.68 
 
 
519 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  48.23 
 
 
509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>