More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08820 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  76.54 
 
 		 510 aa  770    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 513 aa  1041    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 		 503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  51.33 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 556 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 505 aa  495  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 532 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  50.1 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 508 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 541 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 540 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 540 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  48.36 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 541 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.6 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 530 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  52.89 
 
 		 517 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  48.63 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 510 aa  475  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 519 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  45.21 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  51.69 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  47.69 
 
 		 555 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.4 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.09 
 
 		 521 aa  470  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  48.04 
 
 		 624 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3670  pyruvate carboxyltransferase  60.79 
 
 		 384 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0979499  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  48.36 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  47.2 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  47.34 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  47.97 
 
 		 546 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  48.44 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  46.44 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  48.34 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  47.7 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  44.42 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5897  pyruvate carboxyltransferase  58.95 
 
 		 379 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  47.5 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  48.72 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  48.53 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0068  2-isopropylmalate synthase  48.26 
 
 		 523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>