More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2192 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 405 aa  833    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  70.98 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  59.84 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  50.53 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  52.41 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  53.48 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  51.33 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  44.91 
 
 		 514 aa  346  3e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  46.74 
 
 		 514 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  44.39 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  44.13 
 
 		 514 aa  339  5e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  47.92 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  46.63 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  47.92 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  47.65 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  47.37 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  46.13 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  44.44 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  44.72 
 
 		 492 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  50.67 
 
 		 377 aa  311  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  44.17 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  44.44 
 
 		 492 aa  306  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.33 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.97 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.51 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  43.36 
 
 		 492 aa  295  9e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.74 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.02 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  44.03 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  42.2 
 
 		 485 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  41.9 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.71 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  40.63 
 
 		 438 aa  278  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  39.94 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.55 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  38.32 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  41.93 
 
 		 522 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  43.06 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  40.48 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  40.31 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  41.21 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.92 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.44 
 
 		 500 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  38.52 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  43.27 
 
 		 483 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  38.96 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  37.63 
 
 		 377 aa  269  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  42.82 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 		 510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  40.35 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  39.02 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  44.29 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  37.4 
 
 		 377 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  42.54 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  39.95 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  37.4 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  39.6 
 
 		 503 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  38.6 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  42.11 
 
 		 390 aa  264  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.69 
 
 		 509 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.17 
 
 		 509 aa  262  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  38.42 
 
 		 378 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  38.61 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  39.71 
 
 		 516 aa  260  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  36.77 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 515 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  38.34 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  39.78 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  39.07 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  38.23 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  37.57 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  40.4 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  39.83 
 
 		 386 aa  255  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 505 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  39.21 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  38.56 
 
 		 504 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  40.76 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  38.04 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  42.59 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  39.77 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 520 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  40.05 
 
 		 511 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  37.7 
 
 		 377 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  36.34 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 499 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  39.77 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  37.98 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  37.57 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  39.39 
 
 		 515 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  38.9 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  40.42 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 508 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  38.24 
 
 		 520 aa  249  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  39.33 
 
 		 519 aa  249  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  40.05 
 
 		 517 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  38.62 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  39.68 
 
 		 520 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  38.2 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>