More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1776 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  99.73 
 
 		 377 aa  770    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 377 aa  771    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  76.02 
 
 		 382 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  71.16 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  69.52 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  69.48 
 
 		 372 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  68.18 
 
 		 377 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  66.31 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  54.1 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  53.83 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  52.86 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  54.72 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  51.61 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  51.75 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  51.1 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  53.91 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  50.42 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  50.55 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  50.82 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  53.02 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  48.91 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  51.92 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  50.82 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  51.37 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  49.86 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  50.55 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  50.42 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  48.66 
 
 		 398 aa  345  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  48.38 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  49.17 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  46.69 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  46.69 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  45.14 
 
 		 413 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  44.99 
 
 		 378 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  45.9 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  45.99 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  46.59 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  42.97 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  44.54 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  44.93 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  44.9 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  45.98 
 
 		 394 aa  299  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  44.86 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  44.32 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  40.97 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  44.79 
 
 		 379 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  45.4 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  40.74 
 
 		 514 aa  288  9e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  40 
 
 		 492 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  43.33 
 
 		 508 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.6 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.27 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  41.12 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  44.89 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.19 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  39.77 
 
 		 492 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  43.62 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  40.4 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  42.18 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.42 
 
 		 492 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.48 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  39.32 
 
 		 514 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  38.75 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  43.65 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  44.29 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  38.11 
 
 		 393 aa  278  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  38.68 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  41.32 
 
 		 516 aa  275  7e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  42.74 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  42.54 
 
 		 383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  41.39 
 
 		 511 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.57 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  39.17 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  41.19 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  38.89 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  42.17 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  41.37 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.56 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  37.4 
 
 		 405 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  45.02 
 
 		 379 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.57 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  41.74 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  39.6 
 
 		 483 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  44.14 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.56 
 
 		 509 aa  262  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  42.35 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  37.98 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  40.83 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  41.44 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  39.18 
 
 		 438 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  40.06 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  38.95 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  40.22 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  39.3 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  40.3 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  41.6 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  39.94 
 
 		 460 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  35.56 
 
 		 502 aa  255  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  37.74 
 
 		 490 aa  255  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>