More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0505 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  100 
 
 		 381 aa  769    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  53.06 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  50.27 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  49.73 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  47.84 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  45.74 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  49.73 
 
 		 384 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  48.35 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  49.33 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  48.92 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  46.17 
 
 		 392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  45.74 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  48.85 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  48.5 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  46.2 
 
 		 386 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  46.2 
 
 		 386 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  46.79 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  45.19 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  46.51 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  45.92 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  43.51 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.93 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  42.9 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  40.05 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  44.03 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  41.53 
 
 		 385 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  44.14 
 
 		 382 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  40 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  44.99 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.12 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  40 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  44.26 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  43.36 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  44.54 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  42.35 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  43.05 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.89 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  42.78 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  43.87 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  42.08 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  42.59 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  42.78 
 
 		 377 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  41.64 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  41.58 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  47.77 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  41.24 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  38.48 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  39.46 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.78 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  45.66 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  42.82 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  42.29 
 
 		 389 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  44.86 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  45.56 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  43.71 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  41.96 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3580  homocitrate synthase  51.56 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483441  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  41.19 
 
 		 377 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  39.78 
 
 		 375 aa  238  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  40.5 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  38.56 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  45.54 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  40.16 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  38 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  38.96 
 
 		 504 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.72 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.4 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  34.38 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  34.09 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  34.15 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2269  homocitrate synthase  41.18 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.613685  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  35.1 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  38.06 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  32.25 
 
 		 492 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  37.16 
 
 		 516 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  35.1 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  37.53 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  36.67 
 
 		 514 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  36 
 
 		 376 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  35.2 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  36.5 
 
 		 514 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  34.36 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  34.84 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  36.2 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  34.6 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  37.2 
 
 		 509 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  35.02 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  34.13 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  34.58 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  33.15 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.16 
 
 		 504 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  37.53 
 
 		 515 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  35.26 
 
 		 483 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  34.32 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  43.12 
 
 		 287 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  36.83 
 
 		 378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  38.24 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  34.01 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>