More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1624 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 390 aa  805    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  69.11 
 
 		 383 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  64.96 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  63.93 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  63.86 
 
 		 381 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  67.49 
 
 		 385 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  62.77 
 
 		 385 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  41.24 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  41.33 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  41.85 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  42.13 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  41.98 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  42.86 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  42.08 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.2 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  42.58 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  42.51 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  41.8 
 
 		 384 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.33 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  42.22 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  40.87 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  42.2 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  42.08 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  40.05 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  41.24 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  41.24 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  41.89 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  42.03 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  40.37 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  41.26 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  41.87 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  41.8 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  42.08 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  41.8 
 
 		 383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  43.49 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  38.46 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  39.41 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  40.65 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  37.91 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  40.49 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  40.65 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  41.92 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  41.89 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  39.67 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  38.67 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  40.81 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.89 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  38.42 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  38.15 
 
 		 492 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  42.32 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  39.15 
 
 		 508 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.6 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  43.32 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  39.03 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  40.33 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  39.24 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.23 
 
 		 492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  37 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  38.15 
 
 		 514 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  39.78 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  39.66 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  39.34 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  40.37 
 
 		 394 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  39.52 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  42.56 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  37.06 
 
 		 514 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.82 
 
 		 500 aa  235  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  42.35 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  39.52 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  42.98 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  34.13 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  36.61 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  36.74 
 
 		 504 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.01 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  38.02 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  38.97 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  41.55 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  36.46 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  36.24 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  37.75 
 
 		 492 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  36.59 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3580  homocitrate synthase  41.16 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483441  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  35.34 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  37.09 
 
 		 515 aa  226  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  36.18 
 
 		 529 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  37.57 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  36.91 
 
 		 525 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  36.29 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  36.29 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  36.73 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  36.03 
 
 		 529 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  37.4 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  36.98 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  36.86 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  40.23 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>