More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1533 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 393 aa  804    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  60.68 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  59.84 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  54.99 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  53.42 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  52.13 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  52.73 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  48.53 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  47.72 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  47.99 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  49.72 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  48.34 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  49.87 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  47.06 
 
 		 386 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  47.14 
 
 		 492 aa  338  7e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  47.66 
 
 		 492 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  47.38 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  47.47 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.36 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  45.97 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  46.79 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  51.92 
 
 		 377 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  46.28 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  46.59 
 
 		 492 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  47.83 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  51.82 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  47.14 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  48.1 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.6 
 
 		 505 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  48.35 
 
 		 378 aa  312  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  43.26 
 
 		 504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  43.01 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  44.59 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  42.05 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  43.07 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  41.13 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  44.69 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.21 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.99 
 
 		 500 aa  296  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  42.66 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  41.36 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  43.48 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  41.73 
 
 		 438 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  43.21 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.82 
 
 		 347 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  41.19 
 
 		 446 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  42.52 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  41.49 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  41.48 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  42.9 
 
 		 503 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  41.42 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.64 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  42.32 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  39.35 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  39.78 
 
 		 509 aa  278  8e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  38.11 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  38.11 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.16 
 
 		 504 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  38.27 
 
 		 508 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 		 522 aa  276  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  41.39 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  42.04 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  38.11 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  38.74 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  38.42 
 
 		 516 aa  275  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  42.36 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  38.27 
 
 		 515 aa  272  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  40.32 
 
 		 515 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  40.28 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  39.9 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  42.53 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.58 
 
 		 505 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  40.61 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  40.15 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  39.18 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  40.61 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  40.71 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 475 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  41.83 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  39.75 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  39.78 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  40.33 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 506 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  41.55 
 
 		 489 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  40.44 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  39.11 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  39.84 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  38.12 
 
 		 511 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  39.65 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  41.59 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>